2022年已过半,m6A做分型依然是热点!
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发布时间：2024-10-24 17:25
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时间：2024-10-24 21:39
基于m6A调节因子的signature可以区分头颈部鳞状细胞癌患者的预后。
今年m6A依然是研究热点，相关基因作为signature进行分型预后，发表在Front Immunol杂志。
使用TCGA-HNSCC数据，包含546个样本，涉及肿瘤组织、正常组织和转移性癌症组织。
18个m6A调节基因在头颈癌中表达高于正常组织，包括m6A writer、reader和erasers基因，表明m6A修饰与头颈癌发生相关。
通过分析筛选与CNV、突变和转录水平显著相关的m6A调节因子相关基因，发现1598个基因与m6A调节因子表达有关，显著富集于mTOR、自噬和泛素介导的蛋白水解信号通路等。
单变量Cox回归分析58个m6A调节相关基因与头颈癌患者生存相关，Lasso-Cox回归选择12个基因作为预后因素，构建风险模型。
通过PPI网络分析，确定了关键基因，使用SRAMP软件揭示潜在的m6A甲基化修饰位点，构建了m6A特征基因模型。
多变量分析证实高风险组是OS的劣势因素，模型外部验证显示高风险组和低风险组之间OS存在显著差异，风险评分预测免疫治疗效果。
研究发现风险评分与免疫浸润相关，低风险组的免疫细胞浸润类型与高风险组不同，风险评分可用作免疫反应的预后标志物。
本文提供了一种基于m6A调节因子构建风险模型的方法，对头颈部鳞状细胞癌患者预后及免疫治疗效果预测有潜在应用价值。
