一般是不生效的，如果协议有明确条款说明盖章后生效，但只有法人代表签字，没盖公章，协议还不能生效；没有这个盖章后生效的条款，双方有法人代表签字，没盖公章，协议就已经生效，这主要看双方的约定，合同的成立与生效常常是紧密联系在一起的。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第一百四十四条 无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。
第五百零四条 法人的法定代表人或者非法人组织的负责人超越权限订立的合同，除相对人知道或者应当知道其超越权限外，该代表行为有效，订立的合同对法人或者非法人组织发生效力。
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